你好！老师，总公司与赔偿方签了赔偿协议，总公司开出了发票，赔偿方也付了款，总公司作收入收账了。但这工程是子公司做的，子公司又开出发票给总公司，总公司也汇款给了子公司，请问总公司这笔款如何做会计分录？这样的操作流程对吗？

好的好的

您好，总公司收到赔偿款时若为代收代付则借记银行存款贷记其他应付款-子公司，支付时借记其他应付款-子公司贷记银行存款；若确认为收入则借记银行存款贷记营业外收入/应交税费-应交增值税（销项），支付给子公司时凭发票借记工程施工/营业成本/应交税费-应交增值税（进项）贷记银行存款；子公司开具发票时借记应收账款-总公司贷记主营业务收入/应交税费-应交增值税（销项），收款时借记银行存款贷记应收账款-总公司；建议由子公司直接收款开票以避免重复纳税和虚开发票风险。

与总公司签的协议，可以子公司开出发票给对方吗？

 您好，合同签订方与开票方必须一致，总公司签订的协议应由总公司开票；若需子公司开票，必须签订三方补充协议明确子公司为实际执行方或由总公司与子公司签订分包协议，否则可能构成虚开发票风险。

当时总公司开了发票给对方，作收入了，支付给子公司时，借在建工程，贷银行存款，不知能不能这样入这个科目？是工程的赔偿款，但又不像是总公司的在建工程？

 您好，总公司收到工程赔偿款并开票作收入后，支付给子公司时不能直接计入 在建工程 科目。正确的处理应为：如果该款项属于代收代付性质，应通过 其他应付款 科目核算（借：银行存款 贷：其他应付款-子公司；支付时借：其他应付款-子公司 贷：银行存款）；如果确认为总公司收入，则支付给子公司时应根据子公司提供的服务内容计入相应成本费用科目（如 工程施工 等），并取得子公司开具的合规发票，如果不是这样存在虚列成本及税务风险。特别提醒：因该工程实际由子公司实施，总公司账务处理需确保业务实质与票据链、资金流一致，如果不是这样可能被认定为虚开发票或成本不实。