老师你好，我们是建筑分公司，我们有一个项目的保函费是由分公司的账户转出去的，发票是开的总公司的，这个怎么处理呢？

是的，施工合同是和总公司签的

因为地方税源的问题，必须要新设立分公司

 你好 ；     那你们就得开票   ；    这个主要是 分公司来承担的话；  那么总公司到时做费用去 ； 到时这个钱要给分公司的  

就是费用做在总公司的账上，我们付出去的款，总公司再转给我们吗？

 你好； 是的。  如果分公司不承担的话  

需要写什么证据书说明吗？

 你好 ；你们要有 费用合同的；   按照合同双方签订的  双方来确定怎么做账的  

相当于总分公司要签个协议吗？

 你好； 是的。 要有协议证明到底是哪个的    费用 ；  才好判断科目的   

好的，谢谢