某市国税稽查局2016年12月对辖区内的S工业公司(增值税一般纳税人，适用增值税税率17%)2016年度纳税情况进行检查。经查发现，S公司2016年7月至9月间“其他应付款”科目存在异常，经过调取记账凭证进行检查发现有大量销售款未按规定记入“主营业务收入”科目中，经逐项核对“其他应付款”科目中有3510万元(含税)属于销售款，并且此款项没有按规定进行纳税，某市国税稽查局限期5天补税。S公司2016年各月份均没有留抵税额。经查实S公司应将对应的成本进行了结转，该公司应当如何进行调账，并计算应补缴税款(不考虑滞纳金及罚款、地方教育费附加)。