老师，我公司是建筑公司一般纳税人，有一异地施工项目已经竣工验收了，现在是结算期，施工合同签的是5170多万元，外经证按合同填的也是5170多万元，现实际结算才4900多万元，还有后来加的工程活900多万是没有签合同的，签的协议，请问我要怎么做来处理呢？

只不过是合同里面没有约定，你们出一个补充协议就可以的。

后来加的施工有补充协议的，那是不是外经证那里按最后的结算价来填合同金额，比如最后工程结算价是5800万元，外经证上就按这个来填？

这个是的，是这么做的。

把后来的补充协议发上去吗？

对的，是的，需要的。这个合同和你的补充合同需要一块儿的。

老师，那要押3%的质保金，这3%是按最后结算价来计算吗？要开票出去吗？开票出去了挂应收账款吗？

对的，是的，需要的，严格来说应该在发票里面开出来，挂着应收账款。

但是这有可能收不回来了是吧？不开发票也不合理吧？工程都全部结算清完成本了是吧？

你好，你不开发票不合理的。

然后回来的质量扣款你的以后红冲就是了。

老师，那我开票时是：应收账款-质押  贷：主营业务收入   销项税（小企业会计准则），到时收不回来了这应收账款就是坏账了？或者被扣掉一部分，那这被扣掉的我要怎么入账？