请问给分包单位垫付的运费，运输单位把发票开给我单位了，分包单位办理结算时从结算中扣除代付的运费，当时未提出他们要发票事宜，我单位就将运输单位开给我们的发票做了进项税转出。现在分包单位办理最后结算找我单位要发票，我单位能开运输费发票给分包单位吗，当时运输单位开的发票是6%，如果我单位要开运输发票税率是9%，之前转出的进项税能一起开发票要回来吗？

那项目上的水电费能开发票给分包单位吗

同学你好 这个可以开的

国内货物运输代理(除许可业务外，可自主依法经营法律法规非禁止或限制的项目)，营业执照有这段话，能开吗？

同学你好 这个可以的 不需要资质

那我之前转出的进项税怎么办，不能从发票中扣回，能直接从结算中扣除吗？

同学你好 这个可以的

就是说运输费10万，进项转出的1万，我只要开10万运输费发票给分包单位，进项转出的1万在结算支付里扣除就行了

同学你好 对的 是这样

进项转出的1万不需要开票给分包单位的，对方还想让我一起开给他呢，这样他就好做账。但我就想着本来是10万的运输费，开11万给你与实际业务又不一致。怕税务问起来都不知道怎么解释

这种情况下确实不应该给分包单位开具包含进项转出金额的发票。 一方面，进项转出是由于特定原因（如不符合抵扣条件等）进行的税务处理，并非实际的业务交易金额，与实际运输业务不相符，开具这样的发票属于虚开发票行为，会带来严重的税务风险。 另一方面，从业务真实性角度出发，实际发生的运输费是 10 万，就应该按照 10 万开具发票。如果按照分包单位的要求开具 11 万的发票，在税务检查时难以解释其合理性，可能面临税务处罚。

就是按实际发生的业务来，是多少就是多少，可以按不含税金额签合同吗？因为我和运输单位的税率不一样，运输单位是6%，我是9%，按不含税金额签的话，税差我可以拿回来。至于进项转出的部分我直接从结算支付中扣除，这样税务局看的话是不是就没有问题了？