老师您好！现在独立核算的分公司（一般纳税人）因经营困难需要注销，和总公司达成协议：分公司欠总公司应付账款95万（总公司已开票给分公司，分公司已勾选认证并进行进项税抵扣）现在总公司减免给分公司79万。请问这样在税务方面对分公司有什么不利因素？

老师，那样分公司是不是要上企业所得税？如果双方达成协议这样税务局就会追踪分公司的企业所得税？

您好，是的，分公司的营业外收入，总公司有营业外支出，但不能税前扣除

老师，请问分公司已经抵扣的增值税税务局会让补税吗？

您好，不会的哦，我们业务是真实的

业务是真实的配送服务费。但是我想着既然总公司都免债务了，税务局就会让分公司缴纳免除债务的79万抵扣的增值税。

您好，让抵的，总公司的损失不让税前扣除

老师，分公司也是要做营业外收入申报企业所得税的对吗？